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南方红豆杉集药用、材用、观赏于一体，具有较高的开发利用价值。因其种皮透性差，休眠期长，种子繁殖难度大。但只要掌握南方红豆杉的生物学特性，严格按技术规程操作，育苗一定会取得成功，其具体操作如下：
一、圃地选择和施肥 圃地选择以土层深厚、结构疏松、富含有机质、排水良好、不受西晒的稻田为宜(必须是当年收割的稻田土)。整地在收割中晚稻后，土壤干燥后深翻一次，碎土一次，尔后分厢做床。宽床1.5米(净床面宽1.2米，步道宽0.3米)；床高20厘米，苗床长度视苗圃地而定。在整地做床的同时,每亩施入腐熟的猪牛粪8000斤左右，速溶优质复合肥200斤，并拌入呋喃丹6至8斤防治地下害虫。在将肥料翻拌入土层并将整平厢面后，在厢面上填黄心土，厚5厘米。
二、适时播种 种子通过一年的贮藏，有部分裂口。这时筛出洗净，用0.05％的高锰酸钾液浸种消毒10分钟，再用清水冲洗干净，晾干后即可播种。
播种分撒播和条播两种：撒播是将种子均匀地撒在填好黄心土的苗床上，用黄心土覆盖种子，以不见种子为度，再用苔藓将苗床全部覆盖。条播则选取15厘米宽的木板，在填好黄心土的苗床上压播种沟，深2厘米，播种沟之间的距离15至20厘米。将种子均匀播种于沟内，并用黄心土盖种，厚度1厘米，再用苔藓覆盖播种沟。
应注意的是：一是严格控制播种量，每亩用种为15公斤，否则会严重影响二年生苗木合格出苗率；二是播种后，撒播必须用苔藓将苗床全部覆盖，条播只要将苔藓覆盖播种沟。幼苗出土后，也不要将苔藓揭去，长期保持在苗床上。苔藓护苗优点为：保护苗床不受雨水溅击和阳光直射，使苗木不受阳光灼伤及避免因茎、叶沾泥形成泥棒而窒息死亡，并且经常保持土壤疏松、湿润，减少中耕除草用工。但覆盖的苔藓要薄，不能太厚，如遇久旱不雨，可用细黄土压住苔藓，或用喷雾器喷水保持苗床湿润。
三、田间管理
1. 幼苗遮阴 幼苗出土前，必须将阴棚架好，棚高1.7米。三伏天，苗床要用遮阴。
2．病虫害防治 幼苗出土后正值雨季，因雨水多、空气湿度大，幼苗易感染病菌而发生根腐和猝倒病，造成育苗全部失败。故重在于“防”，即在幼苗出土隔7天喷800倍托布津或半量式：波尔多液（0.5硫酸铜、0.5斤石灰、100斤水）喷雾，向幼苗茎干和叶背、叶面喷施。
3. 中耕除草、施肥 在苗木生长期间，注意除草松土，改善土壤通气条件。除草原则为：除小，除早。苗木生长前期追肥，以氮、磷肥为主，用10％的稀入粪尿加0.4斤尿素配制，每隔半月施一次。9月中旬停施，并将遮阴网拆走，棚架留下来年再用。
4．幼苗移栽 如因播种不匀，造成苗木过密过稀，在5月底至6月中旬，须进行苗木移植，间密补稀。移栽方法为：选择阴雨天或雨后进行移栽，覆盖好苔藓后，用清水淋蔸，移栽。
四、二年生苗木管理 在苗木移栽前，将阴棚架好，并及时清除步道和四周杂草。对瘦弱苗加大追肥，促进生长。
通过精细管理，一年生苗高12至25厘米，二年生苗高为30至35厘米，地径粗O.5厘米，亩产苗木达6万株。
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